سازمان بازرگانی آذربایجان شرقی در تاریخ 1/2/1355 تحت عنوان اداره کل بازرگانی آذربایجان شرقی تاسیس شد .در ابتدا سه شهر ، تبریز ،اردبیل و مراغه با 26 نفر کارکنان شروع به فعالیت نمود. پس از تفکیک استان به آذربایجان شرقی واردبیل در فروردين سال1372 ،اداره کل بازرگانی آذربایجان شرقی در قالب 12 شهرستان با 108 نفر نیروی انسانی به فعالیت پرداخت . در حال حاضر پس از ادغام اداره کل بازرگانی و بازرسی و نظارت و تشکیل سازمان بازرگانی آذربایجان شرقی با 196 پست مصوب سازمان مدیریت و برنامه ریزی کشور ، از تاریخ 1/1/1383 با ابلاغ پستها ، سازمان بازرگانی آذربایجان شرقی ، فعالیت خود را با تشکیلات جدید آغاز کرد . هم اکنون سازمان بازرگانی آذربایجان شرقی به جز  مركر استان دارای 18 شهرستان می باشد که در 15 شهرستان در قالب اداره و در سه شهرستان در قالب نمایندگی به کار خدمات رسانی مشغول می باشد .